Мышкинский муниципальный район входит в состав Ярославской области и граничит с Некоузским, Рыбинским, Большесельским, Угличским районами Ярославской области и Тверской областью. Город Мышкин расположен на левом берегу р. Волги между городами Угличем (40 км) и Рыбинском (42 км). Автомобильными дорогами город связан со столицей России Москвой (260 км) и областным центром Ярославлем (92 км). Интенсивное автобусное движение связывает город с железнодорожной станцией Волга (22 км). Город имеет пристань, которая используется для приема круизных теплоходов и транспортно-пассажирский паром через р. Волга.
Территория района – 1116 кв. км (3,1% территории Ярославской области).
Численность населения на 1 января 2008 года –11 тысяч человек.
Центром Мышкинского муниципального района является г. Мышкин – город районного подчинения. Население города – 6 тысяч человек. На территории района расположено 253 сельских населенных пункта, общей численностью населения – 5 тысяч 200 человек.